Поглавјето 12 опфаќа детални правила во областа на безбедноста на храната. Преку општата политика за прехранбени производи, се поставуваат правила за хигиена при производството на храна.
Законодавство од поглавјето 12 обезбедува детални правила од областа на ветеринарството, кои се неопходни за заштита на здравјето на животните, нивната благосостојбата и безбедноста на храната од животинско потекло која е достапна на внатрешниот пазар. Во областа на фитосанитарната политика, правилата на ЕУ опфаќаат прашања како што се квалитетот на семето, материјалот за заштита на растенијата, штетните организми и исхраната на животните.